Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ckap2lQ7TS74 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ckap2lQ7TS74 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ckap2lQ7TS74 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms