Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RfflQ6ZQM0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfflQ6ZQM0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms