Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cand1Q6ZQ38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cand1Q6ZQ38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cand1Q6ZQ38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cand1Q6ZQ38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms