Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg5Q6ZPY2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smg5Q6ZPY2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg5Q6ZPY2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms