Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ddx55Q6ZPL9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx55Q6ZPL9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ddx55Q6ZPL9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddx55Q6ZPL9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx55Q6ZPL9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx55Q6ZPL9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms