Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssxb10Q6XAR7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssxb10Q6XAR7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb10Q6XAR7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb10Q6XAR7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb10Q6XAR7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ssxb10Q6XAR7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms