Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Casc1Q6TDU8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casc1Q6TDU8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc1Q6TDU8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms