Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gja6Q6S5G4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gja6Q6S5G4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja6Q6S5G4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms