Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nudcd1Q6PIP5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nudcd1Q6PIP5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms