Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Med16Q6PGF3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med16Q6PGF3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med16Q6PGF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 786.5 ms