Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W2

Shkbp1, SH3KBP1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shkbp1Q6P7W2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shkbp1Q6P7W2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shkbp1Q6P7W2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shkbp1Q6P7W2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms