Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt87Q6IMF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt87Q6IMF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms