Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pds5aQ6A026 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pds5aQ6A026 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pds5aQ6A026 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms