Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtafrQ62035 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtafrQ62035 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms