Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prg2Q61878 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prg2Q61878 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prg2Q61878 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms