Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim25Q61510 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim25Q61510 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.4 ms