Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mre11Q61216 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mre11Q61216 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms