Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psen2Q61144 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psen2Q61144 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psen2Q61144 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psen2Q61144 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psen2Q61144 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psen2Q61144 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms