Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vdac3Q60931 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vdac3Q60931 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vdac3Q60931 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms