Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Cxcl17Q5UW37 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cxcl17Q5UW37 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cxcl17Q5UW37 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
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