Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh4Q5SX39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myh4Q5SX39 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myh4Q5SX39 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh4Q5SX39 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms