Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CluhQ5SW19 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CluhQ5SW19 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms