Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mdc1Q5PSV9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Mdc1Q5PSV9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Mdc1Q5PSV9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms