Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim58Q5NCC9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim58Q5NCC9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms