Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
1810065E05RikQ5NC41 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
1810065E05RikQ5NC41 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
1810065E05RikQ5NC41 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
1810065E05RikQ5NC41 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms