Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fbxo39Q5NBU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fbxo39Q5NBU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fbxo39Q5NBU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo39Q5NBU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms