Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clhc1Q5M6W3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clhc1Q5M6W3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clhc1Q5M6W3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clhc1Q5M6W3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clhc1Q5M6W3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clhc1Q5M6W3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms