Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH7

Spdya, Speedy protein A, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdyaQ5IBH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SpdyaQ5IBH7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SpdyaQ5IBH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SpdyaQ5IBH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms