Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Srrm1Q52KI8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Srrm1Q52KI8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srrm1Q52KI8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms