Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc3lQ4KL14 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc3lQ4KL14 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3lQ4KL14 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms