Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxn3Q499D0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxn3Q499D0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms