Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samt2Q497M0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samt2Q497M0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms