Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pacs2Q3V3Q7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pacs2Q3V3Q7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms