Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC051142Q3V0M8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BC051142Q3V0M8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms