Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc27Q3V036 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms