Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Kdm5aQ3UXZ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Kdm5aQ3UXZ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5aQ3UXZ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
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