Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTE2

Gm428, Predicted gene 428, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm428Q3UTE2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm428Q3UTE2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm428Q3UTE2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm428Q3UTE2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm428Q3UTE2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm428Q3UTE2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm428Q3UTE2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm428Q3UTE2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms