Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim15Q3UTD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim15Q3UTD9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms