Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc190Q3URK1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc190Q3URK1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms