Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nkain3Q3URJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkain3Q3URJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkain3Q3URJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms