Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q3UPC7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3UPC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3UPC7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q3UPC7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3UPC7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q3UPC7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q3UPC7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q3UPC7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q3UPC7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q3UPC7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q3UPC7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms