Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrc4Q3UP24 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nlrc4Q3UP24 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nlrc4Q3UP24 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms