Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNV2

Cyp2j11, Cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 11, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2j11Q3UNV2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp2j11Q3UNV2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp2j11Q3UNV2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp2j11Q3UNV2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms