Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Parp3Q3ULW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Parp3Q3ULW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp3Q3ULW8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp3Q3ULW8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms