Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdhd2Q3UGR5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdhd2Q3UGR5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms