Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Rnf149Q3U2C5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf149Q3U2C5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf149Q3U2C5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf149Q3U2C5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf149Q3U2C5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rnf149Q3U2C5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rnf149Q3U2C5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rnf149Q3U2C5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rnf149Q3U2C5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Rnf149Q3U2C5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Rnf149Q3U2C5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rnf149Q3U2C5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rnf149Q3U2C5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf149Q3U2C5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Rnf149Q3U2C5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnf149Q3U2C5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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