Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vars2Q3U2A8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vars2Q3U2A8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vars2Q3U2A8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vars2Q3U2A8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms