Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rufy4Q3TYX8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rufy4Q3TYX8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rufy4Q3TYX8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms