Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn4clQ3TYX2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4clQ3TYX2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn4clQ3TYX2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn4clQ3TYX2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms