Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srsf6Q3TWW8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Srsf6Q3TWW8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms